L'obiettivo del premio Innovaciencia è quello di promuovere la cultura scientifica nella società e mostrare i vantaggi forniti dalla scienza e innovazione, a promuovere l'interesse nella ricerca e innovazione tra i giovani e per aumentare il livello di sensibilizzazione sociale sui giovani innovatori e imprenditori pubblicando i loro progetti e idee. I candidati possono partecipare individualmente o in squadre. Ci saranno tre premi: €2,500 (primo premio), €2,000 (secondo premio) e €1,500 (terzo premio). Inoltre, i tre vincitori riceveranno un iPad.
Tutti i candidati devono presentare il modulo di registrazione, una relazione di progetto (massimo 6 pagine), una sintesi del progetto in inglese (massimo 100 parole), un poster del progetto in formato PDF (dimensione 50x70cm) e altri materiali aggiuntivi (foto, video o prototipi). Il limite di età per i candidati è impostato a 30 anni.