Université Jagellonne prend en charge sur les étudiants handicapés par l'intermédiaire de la bourse spéciale. Montant d'une subvention mensuelle dépend du degré d'invalidité, et il peut varier de 150 – 450 PLN. Ce genre de prestation est décerné après avoir soumis une demande de premier cycle.
Tous les étudiants doivent fournir un certificat approprié, ce qui confirme le niveau d'incapacité. Bourse spéciale est accordée jusqu'à la date de validité de ce certificat.