Charles University Prague contribue à couvrir les frais d'hébergement des étudiants au cours de leur étude. Le montant de bourse de logement est défini par le recteur, trois fois par an. Il existe trois catégories de la bourse selon le niveau de revenu et sociale situation du demandeur.
Tous les étudiants de l'Université peuvent présenter une demande pour la bourse sauf ceux ayant une résidence permanente dans la plaque où le siège de leur faculté est situé (Prague, Hradec Kralove, Plzen)